Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZDHHC9Q9Y397 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZDHHC9Q9Y397 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms