Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms