Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms