Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIP2Q9UDT6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms