Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKX1-2Q9UD57 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms