Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms