Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XCL2Q9UBD3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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