Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL28Q9NXS3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL28Q9NXS3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms