Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PGPEP1Q9NXJ5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PGPEP1Q9NXJ5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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