Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVK13-1Q9NX77 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms