Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms