Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB4Q9NTQ9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms