Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms