Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms