Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms