Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR1EQ9GZS1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms