Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE41Q9C0J9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms