Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCSER1Q9C0I3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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