Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM4Q9C037 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms