Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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KRTAP1-5Q9BYS1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-5Q9BYS1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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KRTAP1-5Q9BYS1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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KRTAP1-5Q9BYS1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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KRTAP1-5Q9BYS1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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KRTAP1-5Q9BYS1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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KRTAP1-5Q9BYS1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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KRTAP1-5Q9BYS1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP1-5Q9BYS1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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