Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMP4AQ9BY43 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms