Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms