Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RNF17Q9BXT8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF17Q9BXT8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms