Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC94Q9BW85 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms