Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FYCO1Q9BQS8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FYCO1Q9BQS8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms