Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAD5Q99717 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms