Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCAF11Q99590 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCAF11Q99590 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms