Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP4Q99569 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms