Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAP1L3Q99457 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAP1L3Q99457 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAP1L3Q99457 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAP1L3Q99457 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAP1L3Q99457 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms