Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSF3RQ99062 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms