Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPRD1AQ96P16 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms