Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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