Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms