Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms