Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP4CQ96CF2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP4CQ96CF2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms