Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM52Q96A61 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms