Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM54Q969K7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms