Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR2Q969E8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms