Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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RABGGTAQ92696 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RABGGTAQ92696 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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