Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN4Q92575 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms