Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALLDQ8WX93 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms