Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSH3Q8TE77 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSH3Q8TE77 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms