Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC133065.6-201ENST00000625054 2378 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SVIPQ8NHG7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms