Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPAP2Q8IXW5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms