Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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RAB11FIP4Q86YS3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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