Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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