Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC16A9Q7RTY1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms