Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms