Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A47Q6Q0C1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms