Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL2Q6F5E8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms